Citer cet article : CRP 2012. Description et caractérisation des palmiers du genre Phoenix: génétique. Chapitre 1/3: génotypage. Rédacteur Robert CASTELLANA. Statut: compte-rendu de recherches. Edition en ligne. Lien
- SOMMAIRE DU CHAPITRE
- 1. Echantillons observés
- 2. Marqueurs utilisés
- 3. Bibliographie
- 4. Tutoriels
Ill. Les 3 étapes de l’extraction du DNA: la lyse (avec des détergents), la déprotéination (avec des sels ou du phenol-chloroforme) et la précipitation du DNA par l’alcool (Takween 2007).
CHAPITRE 1/3. RECUEIL DE DONNÉES GENETIQUES. Les recherches présentées ici s’inscrivent dans le cadre de travaux similaires consacrés à la production de données génétiques et moléculaires, ainsi qu’à la mise en place de programmes d’amélioration génétique (comme la diffusion de données d’intérêt général, l’harmonisation des procédures, la comparaison des résultats, les synergies entre instituts de recherche, etc.).
- ECHANTILLON OBSERVE

* Phoenix dactylifera. Les travaux en cours portent plus spécifiquement sur la diversité génétique de Phoenix dactylifera, dont la valeur économique représente un enjeu pour le développement.
*Phoenix canariensis. Les recherches consacrées aux palmiers ornementaux sont peu développées. Elles concernent à la fois les pays du Nord, en matière d’espaces verts, et ceux du Sud en matière de tourisme. Le palmier étudié principalement est Phoenix canariensis, du fait de son importance en terme de réalisations paysagères.
*L’hybridation dans le genre Phoenix. Les hybrides entre les diverses variétés de Phoenix font aussi l’objet d’études innovantes. Elles éclairent sous un nouvel angle les étapes de la spéciation qui ont conduit à la bio-diversité actuelle du genre Phoenix.
En savoir plus: PINTAUD JC. Analyse de marqueurs microsatellites dans le genre Phoenix. Link: PINTAUD J.C.
2. MARQUEURS UTILISES

3. BIBLIOGRAPHIE
BALLARDINI M. 2010. Illustrated protocol for palm leaves sampling, drying and sample preserving for subsequent DNA extraction, as implemented by CRA-FSO in Sanremo (Italy). In: Phoenix Ed. Link: BALLARDINI 2010
Amy BODIAN, Mohamed Aziz EL HOUMAIZI, Khadidiatou NDOYE NDIR, Amina HASNAOUI, Marion NACHTIGALL, Peter WEHLING 2012. Genetic diversity analysis of date palm (Phoenix dactylifera L.) cultivars from Figuig oasis (Morocco) using SSR markers. In: International Journal of Science and Advanced Technology (ISSN 2221-8386) Volume 2 No 3 March 2012. Link: www.ijsat.comMohamed M. SAKR, Wael M. HASSAN, Isam M. Abu ZEID, Abdel-Rahman E. HASSAN, Abd-Elghany E. BAZ, 2012. The Application of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) in the Classification of Egyptian Date Palm (Phoenix dactylifera L) Cultivars. In: Journal of American Science, 2012;8(1), 152-159. Link: /www.jofamericanscience.org/
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ZEHDI S., PINTAUD J.C., BILLOTTE N., OULD MOHAMED SALEM A., SAKKA H., RHOUMA A., MARRAKCHI M., TRIFI M. 2006. Etablissement d’une clé d’identification variétale chez le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) par les marqueurs microsatellites. In: Issue (145): 11-18. Link: /www2.bioversityinternational.org/
Sami S. ADAWY, Ebtissam H. A. HUSSEIN, Samer E. M. E. ISMAIL and Hanaiya A. EL-ITRIBY 2005. Genomic diversity in date palm (Phoenix dactylifera L.) revealed by AFLPs in comparison to RAPDs and ISSR. In: Arab J. Biotech., Vol. 8, No. (1) Jan. (2005): 99-114. Link: /www.acgssr.org/
ADAWY Sami S., HUSSEIN Ebtissam H.A., EL-KISHIN Dina, SAKER Mahmoud M., EL-ITRIBY Hanaiya A. 2002. Genetic variability studies and molecular fingerprinting of some Egyptian date palm (Phoenix dactylifera L.) cultivars. II- RAPD and ISSR profiling. In: Arab J. Biotech., Vol. 5, No.(2) July (2002): 225-236. Link: /www.acgssr.org/
BEN ABDALLAH, STITI, LEPOIVRE, DU JARDIN, 2000. Identification de cultivars de palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) par l’amplification aléatoire d’ADN (RAPD). In: Cahiers Agricultures 9/103-7. Link: /orbi.ulg.ac.be/
4. TUTORIELS

Le site (trilingue Français, Arabe, Anglais), de l’Equipe ‘Biochimie et Biotechnologies des Plantes’ de l’Université Cadi Ayyad (Marrakech, Maroc) rassemble de nombreux articles en rapport avec le développement des biotechnologies, aux gènes résidant dans la biodiversité et à la diversité génétique des espèces. Il présente notamment les biotechnologies classiques (culture des tissus, micropropagation…) et modernes basées sur l’ADN recombiné (produit du génie génétique), et leurs impacts positifs et négatifs sur l’environnement (pollution génique), la biodiversité et la diversité génétique. Une rubrique est consacrée exclusivement au palmier-dattier. On y trouve aussi un annuaire exhaustif des universités et instituts de recherche du Maghreb, avec des liens vers leurs sites, et de nombreux documents pédagogiques. ENTER
Takween 2007. DNA. Amplification par PCR
L’amplification du DNA par PCR comporte la preparation d’un melange reactionnel contenant, entre autre, le DNA, les amorces (primers) et la DNA polymerase. L’amplification par PCR exige la dénaturation du DNA, la fixation des amorces et l’élongation.
Takween 2008. Electrophorèse du DNA
Technique de separation du DNA sur gel d’Agarose (depot des echantillons, migration et revelation).
Takween 2007. Chromatographie sur papier des acides amines
Présentation de travaux pratiques sur les techniques de séparation et d’analyse en Biochimie.